MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081 chromosome

Total Repeats: 76152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008800	TGA	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440404
2	NC_008800	GAT	2	6	378	383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440404
3	NC_008800	CAC	2	6	410	415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440404
4	NC_008800	GA	3	6	469	474	50 %	0 %	50 %	0 %	123440404
5	NC_008800	CTG	2	6	483	488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440404
6	NC_008800	TAA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440404
7	NC_008800	ATT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440404
8	NC_008800	ATG	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440405
9	NC_008800	TCA	2	6	866	871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440405
10	NC_008800	TTG	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440405
11	NC_008800	TAA	2	6	933	938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440405
12	NC_008800	GTG	2	6	956	961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440405
13	NC_008800	CTT	2	6	978	983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440405
14	NC_008800	T	7	7	997	1003	0 %	100 %	0 %	0 %	123440405
15	NC_008800	ATG	2	6	1037	1042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440405
16	NC_008800	AC	3	6	1054	1059	50 %	0 %	0 %	50 %	123440405
17	NC_008800	CCTG	2	8	1112	1119	0 %	25 %	25 %	50 %	123440405
18	NC_008800	T	6	6	1125	1130	0 %	100 %	0 %	0 %	123440405
19	NC_008800	GC	3	6	1195	1200	0 %	0 %	50 %	50 %	123440405
20	NC_008800	ACA	3	9	1472	1480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123440406
21	NC_008800	CTT	2	6	1499	1504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440406
22	NC_008800	AGC	2	6	1519	1524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440406
23	NC_008800	GTAAAA	2	12	1617	1628	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	123440406
24	NC_008800	GTT	2	6	1653	1658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440406
25	NC_008800	CATT	2	8	1659	1666	25 %	50 %	0 %	25 %	123440406
26	NC_008800	TGA	2	6	1751	1756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440406
27	NC_008800	CATT	2	8	1772	1779	25 %	50 %	0 %	25 %	123440406
28	NC_008800	AGC	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440406
29	NC_008800	GC	3	6	1967	1972	0 %	0 %	50 %	50 %	123440406
30	NC_008800	GATTGG	2	12	2042	2053	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	123440406
31	NC_008800	ATG	2	6	2080	2085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440406
32	NC_008800	ATG	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440406
33	NC_008800	ATT	2	6	2154	2159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440406
34	NC_008800	TGA	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440406
35	NC_008800	TGG	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440406
36	NC_008800	TTG	2	6	2358	2363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440406
37	NC_008800	CAA	3	9	2364	2372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123440406
38	NC_008800	TAA	2	6	2439	2444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440406
39	NC_008800	ATT	3	9	2642	2650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440407
40	NC_008800	AAT	2	6	2666	2671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440407
41	NC_008800	TGT	2	6	2752	2757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440407
42	NC_008800	ATT	2	6	2771	2776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440407
43	NC_008800	A	7	7	2790	2796	100 %	0 %	0 %	0 %	123440407
44	NC_008800	ATT	2	6	2960	2965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440407
45	NC_008800	ATTT	2	8	3013	3020	25 %	75 %	0 %	0 %	123440407
46	NC_008800	TTCA	2	8	3110	3117	25 %	50 %	0 %	25 %	123440407
47	NC_008800	CGT	2	6	3171	3176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440407
48	NC_008800	GTG	2	6	3177	3182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440407
49	NC_008800	CAGT	2	8	3189	3196	25 %	25 %	25 %	25 %	123440407
50	NC_008800	GCG	2	6	3288	3293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440408
51	NC_008800	TGC	2	6	3409	3414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440408
52	NC_008800	AAT	2	6	3471	3476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440408
53	NC_008800	CAT	2	6	3488	3493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440408
54	NC_008800	GCC	2	6	3538	3543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440408
55	NC_008800	GCC	2	6	3552	3557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440408
56	NC_008800	TGA	2	6	3606	3611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440408
57	NC_008800	ATG	2	6	3646	3651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440408
58	NC_008800	GCG	2	6	3657	3662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440408
59	NC_008800	TCC	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	123440408
60	NC_008800	GTT	2	6	3776	3781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440408
61	NC_008800	T	6	6	3818	3823	0 %	100 %	0 %	0 %	123440408
62	NC_008800	GCG	2	6	3876	3881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440408
63	NC_008800	ACTC	2	8	3899	3906	25 %	25 %	0 %	50 %	123440408
64	NC_008800	TCGG	2	8	3925	3932	0 %	25 %	50 %	25 %	123440408
65	NC_008800	AAT	2	6	3934	3939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440408
66	NC_008800	GCT	2	6	4100	4105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440408
67	NC_008800	GCA	2	6	4127	4132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440408
68	NC_008800	CAC	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440408
69	NC_008800	GCC	2	6	4181	4186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440408
70	NC_008800	GCC	2	6	4189	4194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440408
71	NC_008800	CAT	2	6	4196	4201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440408
72	NC_008800	CAC	2	6	4226	4231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440408
73	NC_008800	TGT	2	6	4246	4251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440408
74	NC_008800	AGT	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440408
75	NC_008800	TGA	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440408
76	NC_008800	GATGGT	2	12	4299	4310	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	123440408
77	NC_008800	AG	3	6	4346	4351	50 %	0 %	50 %	0 %	123440408
78	NC_008800	TC	3	6	4380	4385	0 %	50 %	0 %	50 %	123440408
79	NC_008800	GCA	2	6	4400	4405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440408
80	NC_008800	TG	3	6	4417	4422	0 %	50 %	50 %	0 %	123440408
81	NC_008800	TTG	2	6	4440	4445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440408
82	NC_008800	CAC	2	6	4452	4457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440408
83	NC_008800	TGT	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440408
84	NC_008800	CAC	2	6	4671	4676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440408
85	NC_008800	TCACTT	2	12	4693	4704	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	123440408
86	NC_008800	AGC	2	6	4711	4716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440408
87	NC_008800	TGT	2	6	4765	4770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440409
88	NC_008800	CAAG	2	8	4842	4849	50 %	0 %	25 %	25 %	123440409
89	NC_008800	GCC	2	6	4868	4873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440409
90	NC_008800	CCA	2	6	4910	4915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440409
91	NC_008800	G	6	6	4923	4928	0 %	0 %	100 %	0 %	123440409
92	NC_008800	TGA	2	6	4965	4970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440409
93	NC_008800	ATC	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440409
94	NC_008800	TTTA	2	8	5076	5083	25 %	75 %	0 %	0 %	123440409
95	NC_008800	GAT	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440409
96	NC_008800	TTTG	2	8	5231	5238	0 %	75 %	25 %	0 %	123440409
97	NC_008800	TGC	2	6	5266	5271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440409
98	NC_008800	TTG	2	6	5325	5330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440409
99	NC_008800	GAA	2	6	5457	5462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123440409
100	NC_008800	GCT	2	6	5540	5545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440409
101	NC_008800	GCT	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440409
102	NC_008800	TCT	2	6	5827	5832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440409
103	NC_008800	CGT	2	6	5851	5856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440409
104	NC_008800	CTT	2	6	5975	5980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440409
105	NC_008800	ATAG	2	8	5992	5999	50 %	25 %	25 %	0 %	123440409
106	NC_008800	CTT	2	6	6011	6016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440409
107	NC_008800	TCA	2	6	6035	6040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440409
108	NC_008800	TTCT	2	8	6224	6231	0 %	75 %	0 %	25 %	123440409
109	NC_008800	TGA	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440409
110	NC_008800	T	6	6	6719	6724	0 %	100 %	0 %	0 %	123440410
111	NC_008800	TCT	2	6	6733	6738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440410
112	NC_008800	GC	3	6	6785	6790	0 %	0 %	50 %	50 %	123440410
113	NC_008800	G	6	6	6807	6812	0 %	0 %	100 %	0 %	123440410
114	NC_008800	CTT	2	6	6899	6904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440410
115	NC_008800	GGT	2	6	6914	6919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440410
116	NC_008800	GCCA	2	8	6926	6933	25 %	0 %	25 %	50 %	123440410
117	NC_008800	CTG	2	6	7023	7028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440410
118	NC_008800	ATT	2	6	7067	7072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440410
119	NC_008800	TGGTT	2	10	7087	7096	0 %	60 %	40 %	0 %	123440410
120	NC_008800	GCT	2	6	7109	7114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440410
121	NC_008800	GCA	2	6	7123	7128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440410
122	NC_008800	CTT	2	6	7181	7186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440410
123	NC_008800	TTTC	2	8	7204	7211	0 %	75 %	0 %	25 %	123440410
124	NC_008800	GGT	2	6	7226	7231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440410
125	NC_008800	ATT	2	6	7339	7344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440410
126	NC_008800	TTA	2	6	7359	7364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440410
127	NC_008800	CTT	2	6	7394	7399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440410
128	NC_008800	CCGT	2	8	7510	7517	0 %	25 %	25 %	50 %	123440410
129	NC_008800	GCC	2	6	7529	7534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440410
130	NC_008800	TAT	2	6	7541	7546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440410
131	NC_008800	AT	4	8	7575	7582	50 %	50 %	0 %	0 %	123440410
132	NC_008800	GGT	2	6	7613	7618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440410
133	NC_008800	TTA	2	6	7693	7698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440410
134	NC_008800	GTTCT	2	10	7704	7713	0 %	60 %	20 %	20 %	123440410
135	NC_008800	CTT	2	6	7748	7753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440410
136	NC_008800	CTT	2	6	7760	7765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440410
137	NC_008800	TGG	2	6	7768	7773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440410
138	NC_008800	ATT	2	6	7775	7780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440410
139	NC_008800	GGT	2	6	7830	7835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440410
140	NC_008800	TGC	2	6	7906	7911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440410
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142	NC_008800	CGG	2	6	7993	7998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440410
143	NC_008800	GTT	2	6	8079	8084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440410
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149	NC_008800	TC	3	6	8649	8654	0 %	50 %	0 %	50 %	123440411
150	NC_008800	ACC	2	6	8711	8716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440411
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152	NC_008800	CAAA	2	8	8944	8951	75 %	0 %	0 %	25 %	123440411
153	NC_008800	ATT	2	6	8996	9001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440411
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158	NC_008800	T	6	6	9218	9223	0 %	100 %	0 %	0 %	123440412
159	NC_008800	GTG	2	6	9234	9239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440412
160	NC_008800	ATT	2	6	9279	9284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440412
161	NC_008800	GGC	2	6	9363	9368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440412
162	NC_008800	ATTG	2	8	9369	9376	25 %	50 %	25 %	0 %	123440412
163	NC_008800	A	7	7	9378	9384	100 %	0 %	0 %	0 %	123440412
164	NC_008800	GC	3	6	9411	9416	0 %	0 %	50 %	50 %	123440412
165	NC_008800	CAG	2	6	9431	9436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440412
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167	NC_008800	TGG	2	6	9478	9483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440412
168	NC_008800	TCA	2	6	9517	9522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440412
169	NC_008800	CTGA	2	8	9546	9553	25 %	25 %	25 %	25 %	123440412
170	NC_008800	TTTA	2	8	9569	9576	25 %	75 %	0 %	0 %	123440412
171	NC_008800	ATG	2	6	9738	9743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440412
172	NC_008800	CT	3	6	9853	9858	0 %	50 %	0 %	50 %	123440412
173	NC_008800	TGGC	2	8	9880	9887	0 %	25 %	50 %	25 %	123440412
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248	NC_008800	GTA	2	6	14056	14061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440416
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253	NC_008800	CG	3	6	14352	14357	0 %	0 %	50 %	50 %	123440416
254	NC_008800	GGC	2	6	14409	14414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440416
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258	NC_008800	AT	3	6	14579	14584	50 %	50 %	0 %	0 %	123440416
259	NC_008800	GAC	2	6	14597	14602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440416
260	NC_008800	TCA	2	6	14606	14611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440416
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262	NC_008800	TAA	2	6	14863	14868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440417
263	NC_008800	ATT	2	6	14891	14896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440417
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391	NC_008800	ATTG	2	8	28713	28720	25 %	50 %	25 %	0 %	123440424
392	NC_008800	AT	3	6	28727	28732	50 %	50 %	0 %	0 %	123440424
393	NC_008800	GGC	2	6	28734	28739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440424
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474	NC_008800	TACCCG	2	12	34879	34890	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	123440428
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495	NC_008800	TAA	2	6	35901	35906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440429
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497	NC_008800	AAT	2	6	35995	36000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440429
498	NC_008800	GCCGC	2	10	36004	36013	0 %	0 %	40 %	60 %	123440429
499	NC_008800	GCC	2	6	36018	36023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440429
500	NC_008800	GCG	2	6	36070	36075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440429

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